이윤태

Lee, Yoontae,  Ph.D.

분자.생명과학부 및 생명과학과 조교수
마우스 분자 유전학

2006  Ph.D., Seoul National University
2011  Postdoctoral Fellow HHMI,
        Baylor College of Medicine

중점연구분야 |  주요논문

중점연구분야 (Research Interests)

본 연구실에서는 아직까지 많은 연구가 되어 있지 않은 전사 억제 인자인 Capicua (Cic)- Ataxin-1 (Atxn1)/Ataxin-1 Like (Atxn1L) complex 의 생리학적인 역할 및 암과 같은 여러 질병들에서 담당하는 역할 들을 마우스 동물 모델을 이용하여 연구한다. 그리고, 더 나아가 Cic-Atxn1/Atxn1L transcription repressor에 의해 직접 조절되는 target 유전자들을 발굴하여 세포 안에서 이 전사 억제 인자들에 의해 진행되는 molecular pathway들을 이해한다. 궁극적으로, Cic-Atxn1/Atxn1L 단백질체의 역할을 명확히 규명함으로써 암과 같은 질병들의 발병 기전을 보다 잘 이해하는데 연구의 의의가 있을 것 이다.

1. Role of Cic-Atxn1/Atxn1L transcription repressor complexes in cancer progression

선행 연구를 통해 Cic-Atxn1/Atxn1L 전사 억제 단백질체가 발현이 되지 않는 마우스들 (knock-out mice)의 경우 hydrocephalus (수두증), omphalocoele (제대탈장), lung alveolarization defect등 extracellular matrix (ECM) remodeling이 잘 못 조절될 때 발생되는 developmental problem들을 갖는다는 사실을 알게 되었다 (Lee et al. 2011. Dev Cell.). 분자 수준에서는 이 전사 인자의 결함이 여러 종류의 Matrix metalloproteinase (Mmp)들의 과발현을 유도하게 되고, 증가된 양의 Mmp 효소들이 결국 ECM remodeling이 잘 못 되도록 유도하게 된다 (그림 참조). 한편 암발생과 전이 과정에서 ECM remodeling이 잘못 조절된다는 것과 이는 Mmp 의 과발현에 의해서 매게될 수 있다는 사실은 잘 알려져 있다. 그렇다면 이 Cic-Atxn1/Atxn1L 전사 억제 단백질체의 결함이 과연 암의 발생과 전이에 실제로 영향을 주게 될까? 이 질문에 대답하기 위해 본 연구실에서는 여러가지 생쥐 모델을 이용하여 Cic-Atxn1/Atxn1L 전사 억제 단백질체의 암 발병과 전이에서의 기능을 테스트하고자 한다.

2.Investigation of molecular mechanism underlying phenotypes
   in the Cic-Atxn1/Atxn1L deficient mice

보다 구체적이고 명확한 Cic-Atxn1/Atxn1L 전사 억제 인자의 기작을 이해하기 위해 전체 genome 수준에서 target 유전자들을 발굴하고자 한다. 직접적인 DNA 결합 능력을 갖는 Cic는 DNA 서열 특이적으로 DNA에 결합한다. 현재까지 알려진 Cic의 DNA binding motif는 TGAATGAA 혹은 TGAATGGA이다. 따라서 Cic 단백질에 대한 ChIP-seq, Cic knock-out mouse에서의 transcriptome analysis, 그리고 bioinformatics를 통한 전체 유전자의 DNA sequence 분석을 조합하여 보다 가능성이 높은 Cic-Atxn1/Atxn1L 전사 억제 인자의 직접적인 taget 유전자들을 발굴한다. 이때 단백질을 coding하는 유전자들 뿐만 아니라, microRNA와 같은 non-coding RNA에 대해서도 이 전사 억제 인자에 의해 직접적으로 조절될 수 있는지 여부를 타진한다. 이후 이렇게 발굴된 target 유전자들의 발현 변화가 in vivo에서 실제로 어떠한 결과를 초래하는지를 마우스 모델을 이용하여 연구한다.

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주요논문 (Selected Publications)

1. Lee, Y., Fryer, J.D., Kang, H., Crespo-Barreto, J., Bowman, A.B., Kahle, J.J., Gao, Y., Hong, J.S., Kheradmand, F., Orr, H.T., Finegold, M.J. and Zoghbi, H.Y. Atxn1 protein family and Cic regulate extracellular matrix remodeling and lung alveolarization. Developmental Cell. 2011 in press
2. Lee, Y., Samaco, R.C., Gatchel, J.R., Thaller, C., Orr, H.T. and Zoghbi, H.Y. miR-19, miR-101, and miR-130 co-regulate ATXN1 levels to potentially modulate SCA1 pathogenesis. Nature Neuroscience. 2008; 11:1137-9
3. Han, J.*, Lee, Y.*, Yeom, K.-H.*, Nam, J.-W., Heo, I., Rhee, J.-K., Sohn, S.Y., Cho, Y., Zhang, B.-T., and Kim, V.N. (*co-first authors) Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha-DGCR8 complex. Cell. 2006; 125(5):887-901
4. Lee, Y.*, Hur, I.*, Park, S.-Y.*, Kim, Y.-K., Suh, M.R., and Kim, V.N. (*co-first authors) The role of PACT in the RNA silencing pathway. EMBO Journal. 2006; 25:522-532.
5. Lee, Y., Kim, M.J., Han, J., Yeom, K.-H., Lee, S.H., Baek, S.H. and Kim, V.N. MicoRNA genes are transcribed by RNA polymerase II. EMBO Journal. 2004; 23:4051-4060.
6. Han, J.*, Lee, Y.*, Yeom, K.-H., Kim, Y.-K., Jin, H., and Kim, V.N. (*co-first authors) The Drosha-DGCR8 complex in primary microRNA processing. Genes and Development. 2004; 18:3016-3027.
7. Lee, Y., Ahn, C., Han, J., Choi, H., Kim, J., Yim, J., Lee, J., Provost, P., Rådmark, O., Kim, S., and Kim, V.N., The Nuclear RNase III Drosha Initiates MicroRNA Processing. Nature. 2003; 425:415-419.
8. Lee, Y., Jeon, K.P., Lee, J.T., Kim, S and Kim, V.N., MicroRNA maturation: stepwise processing and subcellular localization. EMBO Journal. 2002; 21:4663-4670.

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